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Nov 28, 2023

Collecte d'échantillons biologiques du parent

BMC Nutrition volume 8, Numéro d'article : 141 (2022) Citer cet article 1397 Accès à 3 détails d'Altmetric Metrics Les échantillons biologiques humains non invasifs, y compris les selles, l'urine et les cheveux, sont importants dans

BMC Nutrition volume 8, Numéro d'article : 141 (2022) Citer cet article

1397 Accès

3 Altmétrique

Détails des métriques

Les échantillons biologiques humains non invasifs, notamment les selles, l'urine et les cheveux, sont importants pour comprendre la relation entre le régime alimentaire et les changements dans les processus physiologiques humains qui affectent l'évolution des maladies chroniques. Cependant, la collecte d’échantillons biologiques peut être difficile lors de la collecte d’échantillons pour des études de recherche menées loin d’un emplacement centralisé. Nous décrivons le protocole et la faisabilité de la collecte d'échantillons biologiques de selles, d'urine et de cheveux auprès de parents et de leurs enfants dans un endroit éloigné dans le cadre d'une intervention basée sur un jardin communautaire d'été.

Les selles, l'urine et les cheveux ont été collectés dans le cadre de l'étude Summer Harvest Adventure (SHA), une intervention randomisée et contrôlée basée sur un jardin communautaire ciblant les enfants (âgés de 8 à 11 ans) et leurs parents issus de quartiers à faibles ressources. Des échantillons biologiques ont été collectés auprès d'enfants volontaires et/ou de leurs parents/adultes tuteurs au départ et après l'intervention pour l'évaluation du microbiome, de la métabolomique et des analyses capillaires parmi les groupes d'intervention et les groupes témoins dans un endroit éloigné des laboratoires universitaires effectuant l'analyse. Le protocole utilisé pour assembler, livrer, collecter et traiter les échantillons biologiques est présenté ainsi que la fréquence à laquelle les échantillons ont été obtenus avec succès.

Cent quarante-six participants (73 dyades parent-enfant) faisaient partie de la plus grande étude SHA et étaient donc éligibles pour fournir un échantillon biologique. Au total, 126 participants, 115 participants et 127 participants ont consenti à fournir respectivement leurs échantillons de cheveux, de selles et d'urine. Parmi les participants qui ont consenti à fournir un échantillon, 44 enfants (69,8 %) et 38 parents (60,3 %) ont fourni au moins un échantillon de cheveux, 27 enfants (48,2 %) et 37 parents (62,7 %) ont fourni au moins un échantillon de selles. et 36 enfants (57,1 %) et 42 parents (65,6 %) ont fourni au moins un échantillon d'urine. La collecte d'échantillons hors site, le transport et la manipulation au centre universitaire ont été couronnés de succès et tous les échantillons biologiques ont été jugés adéquats pour les analyses. Le rendement de l'ADN et de la métabolomique sur un sous-ensemble d'échantillons de selles obtenus a fourni d'excellents résultats en termes d'abondance d'espèces et de métabolites, comme on pouvait s'y attendre. Des analyses d'urine et de cheveux sont en cours.

Notre travail est l'un des premiers à décrire la faisabilité de la collecte d'échantillons biologiques humains, en particulier de selles, d'urine et de cheveux, auprès des parents et de leurs enfants issus de quartiers à faibles ressources dans un cadre de recherche sur les jardins non traditionnel. Les travaux futurs rapporteront les résultats liés aux mécanismes entre l’alimentation, le microbiome, les métabolites et les résultats cliniques.

Rapports d'examen par les pairs

Les biospécimens, les échantillons de recherche biologique prélevés sur des humains, jouent un rôle important en nous aidant à comprendre les liens mécanistiques entre l'apport alimentaire et les changements physiologiques [1,2,3,4,5,6]. Les échantillons biologiques non invasifs, en particulier les échantillons biologiques de selles, d'urine et de cheveux, constituent un domaine de recherche important et en pleine croissance et peuvent fournir un aperçu des processus biologiques internes sans avoir besoin d'être invasifs, ce qui peut accroître la volonté des participants aux études de recherche de fournir un échantillon. Par exemple, chez les adultes, les activités du microbiome intestinal peuvent jouer un rôle médiateur dans la relation entre l’apport alimentaire et les modifications de la pression artérielle par l’intermédiaire de métabolites tels que les acides gras à chaîne courte (AGCC), qui peuvent être mesurés dans les selles [7, 8]. Les échantillons biologiques d’urine peuvent refléter des habitudes alimentaires qui augmentent le risque de maladie cardiovasculaire grâce à la mesure du N-oxyde de triméthylamine dans l’urine [9]. Des échantillons biologiques de cheveux ont été utilisés pour mesurer le stress chronique via le cortisol et, plus récemment, pour estimer la consommation de boissons sucrées via les isotopes capillaires (10, 11, 12).

Les relations entre l’apport alimentaire, le microbiote intestinal et urinaire, les métabolites et les changements physiologiques sont peu étudiées, en particulier chez les enfants et les familles en général [13,14,15]. Pour bien comprendre les liens mécanistiques entre l'apport alimentaire et les changements physiologiques, des échantillons biologiques sont nécessaires auprès d'une variété de participants, y compris ceux issus de groupes raciaux/ethniques minoritaires et de familles issues de quartiers à faibles ressources. Cependant, la collecte d'échantillons biologiques auprès de ces groupes a été très limitée pour diverses raisons [16, 17], notamment un niveau inférieur de compréhension de l'utilisation des échantillons biologiques, la nécessité de stratégies de collecte flexibles et un fardeau associé à la participation aux essais [18,19 ,20]. Ainsi, des protocoles efficaces, réalisables et pratiques pour collecter des échantillons biologiques dans divers contextes et populations sont nécessaires.